Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rp1P56716 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp1P56716 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp1P56716 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp1P56716 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp1P56716 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp1P56716 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp1P56716 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp1P56716 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp1P56716 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp1P56716 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp1P56716 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rp1P56716 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms