Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd38P56528 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd38P56528 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd38P56528 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms