Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AgrpP56473 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AgrpP56473 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AgrpP56473 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
AgrpP56473 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
AgrpP56473 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
AgrpP56473 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms