Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp1P55194 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sh3bp1P55194 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms