Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtskP55097 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtskP55097 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtskP55097 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtskP55097 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtskP55097 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtskP55097 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtskP55097 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtskP55097 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtskP55097 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtskP55097 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CtskP55097 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtskP55097 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtskP55097 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtskP55097 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtskP55097 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CtskP55097 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CtskP55097 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtskP55097 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtskP55097 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtskP55097 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtskP55097 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtskP55097 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtskP55097 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtskP55097 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CtskP55097 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtskP55097 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtskP55097 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtskP55097 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CtskP55097 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtskP55097 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtskP55097 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtskP55097 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtskP55097 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtskP55097 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtskP55097 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtskP55097 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtskP55097 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtskP55097 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtskP55097 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtskP55097 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtskP55097 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtskP55097 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtskP55097 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtskP55097 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtskP55097 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CtskP55097 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtskP55097 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtskP55097 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtskP55097 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtskP55097 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtskP55097 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtskP55097 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtskP55097 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtskP55097 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtskP55097 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtskP55097 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtskP55097 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtskP55097 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtskP55097 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms