Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PklrP53657 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PklrP53657 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PklrP53657 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PklrP53657 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PklrP53657 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PklrP53657 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PklrP53657 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PklrP53657 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PklrP53657 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PklrP53657 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PklrP53657 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PklrP53657 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PklrP53657 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PklrP53657 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PklrP53657 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PklrP53657 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PklrP53657 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PklrP53657 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PklrP53657 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PklrP53657 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PklrP53657 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PklrP53657 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PklrP53657 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PklrP53657 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PklrP53657 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PklrP53657 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PklrP53657 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PklrP53657 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PklrP53657 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PklrP53657 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PklrP53657 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PklrP53657 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PklrP53657 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PklrP53657 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PklrP53657 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PklrP53657 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PklrP53657 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PklrP53657 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PklrP53657 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PklrP53657 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PklrP53657 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PklrP53657 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PklrP53657 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PklrP53657 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PklrP53657 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PklrP53657 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PklrP53657 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PklrP53657 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PklrP53657 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PklrP53657 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PklrP53657 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PklrP53657 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PklrP53657 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PklrP53657 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PklrP53657 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PklrP53657 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PklrP53657 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PklrP53657 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PklrP53657 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PklrP53657 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PklrP53657 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PklrP53657 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PklrP53657 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PklrP53657 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PklrP53657 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PklrP53657 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PklrP53657 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PklrP53657 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PklrP53657 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PklrP53657 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PklrP53657 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms