Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cux1P53564 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cux1P53564 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux1P53564 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux1P53564 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux1P53564 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux1P53564 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cux1P53564 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux1P53564 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux1P53564 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cux1P53564 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms