Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ApodP51910 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ApodP51910 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApodP51910 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApodP51910 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApodP51910 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApodP51910 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApodP51910 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApodP51910 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApodP51910 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApodP51910 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApodP51910 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApodP51910 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApodP51910 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApodP51910 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ApodP51910 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApodP51910 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApodP51910 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApodP51910 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApodP51910 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApodP51910 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApodP51910 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApodP51910 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApodP51910 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ApodP51910 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ApodP51910 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms