Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1swP51491 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms