Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BckdhaP50136 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BckdhaP50136 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BckdhaP50136 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BckdhaP50136 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BckdhaP50136 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BckdhaP50136 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BckdhaP50136 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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BckdhaP50136 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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BckdhaP50136 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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BckdhaP50136 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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BckdhaP50136 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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BckdhaP50136 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BckdhaP50136 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms