Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hcls1P49710 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms