Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtpreP49446 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpreP49446 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtpreP49446 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtpreP49446 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtpreP49446 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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