Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox1P48437 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox1P48437 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prox1P48437 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms