Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VdrP48281 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VdrP48281 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VdrP48281 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VdrP48281 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VdrP48281 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VdrP48281 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VdrP48281 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VdrP48281 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VdrP48281 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VdrP48281 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VdrP48281 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VdrP48281 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VdrP48281 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VdrP48281 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VdrP48281 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VdrP48281 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VdrP48281 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VdrP48281 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VdrP48281 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VdrP48281 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VdrP48281 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VdrP48281 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VdrP48281 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VdrP48281 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VdrP48281 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VdrP48281 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VdrP48281 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VdrP48281 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VdrP48281 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VdrP48281 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VdrP48281 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VdrP48281 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms