Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbx2P48031 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbx2P48031 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms