Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Resp18P47939 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Resp18P47939 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Resp18P47939 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Resp18P47939 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Resp18P47939 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Resp18P47939 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms