Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CratP47934 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CratP47934 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CratP47934 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CratP47934 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CratP47934 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CratP47934 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CratP47934 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CratP47934 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CratP47934 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CratP47934 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CratP47934 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CratP47934 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CratP47934 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CratP47934 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CratP47934 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CratP47934 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CratP47934 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CratP47934 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CratP47934 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CratP47934 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CratP47934 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CratP47934 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CratP47934 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CratP47934 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CratP47934 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CratP47934 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CratP47934 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CratP47934 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CratP47934 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CratP47934 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CratP47934 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CratP47934 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CratP47934 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CratP47934 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CratP47934 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CratP47934 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CratP47934 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CratP47934 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CratP47934 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms