Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrprbP47758 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrprbP47758 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrprbP47758 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrprbP47758 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrprbP47758 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms