Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab11bP46638 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab11bP46638 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms