Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf1P46099 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf1P46099 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf1P46099 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf1P46099 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf1P46099 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf1P46099 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms