Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx2-2P42586 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkx2-2P42586 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms