Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nkx2-5P42582 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nkx2-5P42582 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms