Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VhlP40338 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VhlP40338 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VhlP40338 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VhlP40338 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VhlP40338 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VhlP40338 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VhlP40338 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VhlP40338 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VhlP40338 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VhlP40338 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VhlP40338 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VhlP40338 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
VhlP40338 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VhlP40338 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
VhlP40338 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VhlP40338 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VhlP40338 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VhlP40338 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VhlP40338 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VhlP40338 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VhlP40338 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VhlP40338 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VhlP40338 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VhlP40338 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VhlP40338 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VhlP40338 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms