Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ThpoP40226 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ThpoP40226 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ThpoP40226 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms