Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf2P39429 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf2P39429 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf2P39429 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf2P39429 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Traf2P39429 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf2P39429 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf2P39429 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf2P39429 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf2P39429 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Traf2P39429 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf2P39429 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf2P39429 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf2P39429 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms