Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lig1P37913 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lig1P37913 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lig1P37913 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lig1P37913 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lig1P37913 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms