Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpargP37238 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpargP37238 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpargP37238 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpargP37238 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PpargP37238 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PpargP37238 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpargP37238 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpargP37238 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpargP37238 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpargP37238 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpargP37238 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpargP37238 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpargP37238 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpargP37238 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpargP37238 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpargP37238 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PpargP37238 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpargP37238 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpargP37238 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpargP37238 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpargP37238 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms