Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn1P35821 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms