Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ddit3P35639 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddit3P35639 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms