Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab20P35295 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab20P35295 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab20P35295 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms