Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab6aP35279 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms