Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sftpa1P35242 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sftpa1P35242 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms