Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptpn11P35235 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptpn11P35235 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptpn11P35235 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptpn11P35235 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptpn11P35235 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptpn11P35235 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptpn11P35235 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptpn11P35235 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptpn11P35235 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ptpn11P35235 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms