Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp12P34960 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp12P34960 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms