Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola1P33609 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pola1P33609 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pola1P33609 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola1P33609 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pola1P33609 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola1P33609 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola1P33609 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola1P33609 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pola1P33609 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms