Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nedd1P33215 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd1P33215 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms