Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rom1P32958 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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