Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gsx2P31316 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms