Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa2P31245 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms