Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr1P30548 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr1P30548 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms