Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RxraP28700 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RxraP28700 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RxraP28700 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RxraP28700 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RxraP28700 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RxraP28700 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RxraP28700 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RxraP28700 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RxraP28700 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RxraP28700 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RxraP28700 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RxraP28700 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RxraP28700 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RxraP28700 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RxraP28700 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RxraP28700 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RxraP28700 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RxraP28700 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RxraP28700 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RxraP28700 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RxraP28700 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RxraP28700 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RxraP28700 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RxraP28700 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RxraP28700 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RxraP28700 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RxraP28700 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RxraP28700 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RxraP28700 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RxraP28700 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RxraP28700 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms