Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dusp1P28563 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dusp1P28563 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms