Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Hoxd10P28359 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxd10P28359 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Hoxd10P28359 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxd10P28359 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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