Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LoxP28301 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LoxP28301 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LoxP28301 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
LoxP28301 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LoxP28301 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LoxP28301 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LoxP28301 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LoxP28301 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LoxP28301 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LoxP28301 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LoxP28301 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LoxP28301 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LoxP28301 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LoxP28301 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LoxP28301 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LoxP28301 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LoxP28301 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LoxP28301 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LoxP28301 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LoxP28301 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LoxP28301 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LoxP28301 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LoxP28301 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LoxP28301 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LoxP28301 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LoxP28301 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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