Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmo2P25801 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo2P25801 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms