Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd247P24161 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms