Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gria1P23818 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gria1P23818 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gria1P23818 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gria1P23818 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms