Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cd3eP22646 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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