Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a2P20490 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a2P20490 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a2P20490 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a2P20490 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a2P20490 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a2P20490 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a2P20490 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a2P20490 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a2P20490 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a2P20490 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a2P20490 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a2P20490 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ms4a2P20490 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ms4a2P20490 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms