Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P20040 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P20040 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P20040 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P20040 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P20040 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P20040 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P20040 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P20040 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P20040 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P20040 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms